Skripsi

Studi filogenetik berdasarkan gen 16s rrna dan analisis morfometrik pada katak genus microhyla dari beberapa sumber mata air di Malang Raya / Fatchul Yusron Nawawi

Abstrak
Ekosistem perairan di beberapa Sumber Mata Air di Malang Raya Jawa Timur memiliki tingkat keanekaragaman rendah yang mengindikasikan ketidakstabilan ekosistem. Untuk merespon penurunan keanekaragaman jenis herpetofauna yang ada di lokasi-lokasi potensial di Malang maka perlu dilakukan penelitian pada kelompok hewan Amphibia khususnya genus Microhyla yang sering terjadi cryptic spesies. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengevaluasi dan menambah database untuk studi taksonomi hewan khususnya katak dari genus Microhyla. Penelitian ini dilakukan dengan mengisolasi 9 sampel DNA Microhyla orientalis dan 1 sampel Microhyla palmipes dari beberapa Sumber Mata Air di Malang Raya yang kemudian dilakukan amplifikasi terhadap Sekuen gen 16S rRNA dengan primer forward 16L2 dan primer reverse 16H1 . Amplikon Sekuen gen target di sequencing di 1st BASE Laboratories Malaysia. Untuk analisisnya juga menggunakan 12 sekuen Microhyla dari GenBank (termasuk Outgroup). Analisis filogenetik dilakukan dengan menggunakan software MEGA-X dan MrBayes3.2.7. Berdasarkan hasil PCR gen target berhasil diamplifikasi dan diurutkan sepanjang plusmn 891bp. Hasil rekonstruksi filogenetik menghasilkan 5 clade dan memiliki nilai BPP yang baik dengan rata-rata BPP 100. Hasil analisis jarak genetik sampel Microhyla orientalis dan Microhyla palmipes di Kawasan Malang Raya memiliki jarak genetik kurang dari 3% dengan sampel Microhyla orientalis dan Microhyla palmipes dari luar Kawasan Malang Raya. Berdasarkan hasil analisis PCA terhadap karakter morfometrik sampel menggambarkan bahwa pengelompokan populasi sampel sudah cukup jelas sesuai dengan lokasi pengkoleksian sampel.

Informasi Detail

DDC

Rs 572.89 NAW s

Prodi

Universitas Negeri Malang. Program Studi Biologi, 2021.

Deskripsi Fisik

ix, 52 lembar : il. ; 30 cm.

Bahasa

Indonesia

No Reg

03053/KI/22

Edisi

Skripsi (Sarjana)--Universitas Negeri Malang. 2021

Subjek

1. RNA (GENETIKA)
2. KATAK - FILOGENETIK
3. RNA (GENETICS)

Pembimbing

1. Fatchur Rohman ; 2. Bagus Priambodo

Lampiran Berkas