Tesis

Keanekaragaman genetik ekor pegas (subkelas collembola) berdasarkan sekuens gen cytochrome oxidase subunit i (coi) dna mitokondria di wilayah Malang / Idris Hermawan

Abstrak
Keragaman hayati berupa serangga di Indonesia sangat beragam terdapat kurang lebih 250.000 dari 751.000 jenis serangga dari seluruh dunia berada di Indonesia. Khususnya ekor pegas (springtails) yang masuk dalam subkelas Collembola sebagai arthropoda tanah. Ekor pegas sendiri merupakan mikrofauna tanah (ukuran panjang tubuh berkisar 0 25-8 mm) dan masuk dalam kategori mesofauna tanah karena sebagian besar masa hidupnya berada di tanah (dalam dan permukaan tanah). Peran besar yang dimiliki ekor pegas bertolak belakang dengan ukuran tubuhnya yaitu sebagai indikator perubahaan kesehatan tanah sedangkan dalam ekosistem ekor pegas berperan sebagai detritivor (perombak serasah). Studi molekuler menggunakan DNA mitokondria sebagai penanda genetik dalam studi keragaman investigasi kekerabatan dan identifikasi taksonomi telah lama digunakan oleh para ahli sebagai penanda genetik. Gen penanda genetik DNA mitokondria adalah cytochrome oxidase subunit I. Keuntungan penggunaan penanda genetik dari mtDNA yaitu memiliki laju evolusi tinggi sangat konservatif dan genomnya tidak mengalami rekombinasi (hanya diturunkan secara maternal). Studi keragaman genetik menggunakan sekuens DNA pada ekor pegas masih kurang adanya penelitian penelitian ini bertujuan sebagai langkah awal konservasi dengan menghimpun database keragaman genetik dan menjelaskan kekerabatan ekor pegas dari wilayah Malang berdasarkan sekuens gen COI mtDNA. Metode jebakan sumur (pitfall trap) digunakan dalam pengambilan sampel spesimen dari wilayah Malang yang meliputi Cangar (Kota Batu) Bedengan (Kecamatan Dau) dan Tambakasri (Kecamatan Sumbermanjing wetan). Sampel yang digunakan dalam analisis molekuler berupa spesimen yang mendominasi dari setiap lokasi. Metode yang digunakan pada 3 sampel ekor pegas yaitu isolasi DNA dari seluruh tubuh sampel uji kuantitatif. Kemudian dilakukan mekanisme amplifikasi gen COI dan proses sekuensing. Diperoleh hasil sekuensing dilakukan analisis data yaitu analisis diversitas genetik analisis kekerabatan dan diversitas haplotipe. Hasil dari penelitian ini merupakan gen target amplifikasi dari seluruh sampel ekor pegas berhasil dilakukan dan menunjukkan panjang fragmen DNA 600-750 bp. Ketiga sampel ekor pegas yang diteliti memiliki diversitas genetik tergolong tinggi dan teridentifikasi bagian dari anggota famili entomobryidae. Rekonstruksi pohon filogenetik dari 3 sampel ekor pegas yang diteliti dan 10 spesies dari NCBI sebagai pembanding menunjukkan bahwa sampel Col_1 berkerabat dekat dengan Homidia socia Denis dengan percabangan paraphyletic (ML dan NJ) Col_2 berkerabat dekat dengan Homidia cingula B ouml rner dengan percabangan polyphyletic (ML dan NJ) dan Col_3 berkerabat dengan Entomobrydae sp. paraphyletic (NJ). Distribusi haplotipe tediri dari 11 individu in-group dengan nilai keragaman haplotipe sebesar 0 9872. Saran berdasarkan temuan hasil penelitian yakni perlu dilakukan penelitian lanjutan dalam lingkup populasi agar mendapatkan informasi persebaran ekor pegas kemudian melakukan identifikasi morfologi secara mendalam untuk identifikasi taksonomi dan klasifikasi data untuk studi genetika molekuler dapat menggunakan gen spesifik lain guna peningkatan database ekor pegas sebagai masukan plasma nutfah dalam rangka awal konservasi jangka panjang.

Informasi Detail

DDC

Rt 595.71 HER k

Prodi

Universitas Negeri Malang. Program Studi Biologi, 2021.

Deskripsi Fisik

xiv, 58 lembar : il. ; 30 cm.

Bahasa

Indonesia

No Reg

00523/KI/22

Edisi

Tesis (Pascasarjana)--Universitas Negeri Malang. 2021

Subjek

1. SERANGGA - KEANEKARAGAMAN
2. SERANGGA EKOR PEGAS
3. INSECT - VARIETY

Pembimbing

1. Suhadi

Lampiran Berkas