Tesis
Kajian struktur komunitas dan analisis keragaman genetik ikan air tawar di sungai Brantas Kabupaten Malang / Restu Fitriani
Abstrak
Aktivitas antropogenik yang dilakukan sebagai pemanfaatan Sungai Brantas dikhawatirkan dapat mempengaruhi struktur komunitas dan menyebabkan terjadinya perubahan variasi genetik ikan asli Sungai Brantas. Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis dan membandingkan struktur komunitas ikan serta membedakan keragaman genetik ikan di daerah standing water dan stream water Sungai Brantas Kabupaten Malang. Penelitian ini merupakan penelitian deskriptif eksplortif dengan pendekatan kuantitatif. Metode pengambilan sampel struktur komunitas seara puposive sampling menggunakan alat tangkap jaring. Analisis keragaman genetik dengan cara isolasi DNA PCR amplifikasi dan skuensing. Penelitian ini berhasil memperoleh 14 jenis ikan dari 6 suku yaitu Chanidae Cyprinidae Cichlidae Butidae Channidae dan Mastacembelidae. Struktur komunitas di Sungai Brantas Kabupaten Malang dapat dikategorikan dengan tingkat keanekaragaman sedang dengan nilai 1 62 dan 1 88 kemerataan yang tinggi dengan nilai 0 61 dan 0 75 kekayaan jenis rendah dengan nilai 1 86 dan 1 69 serta dominasi yang rendah dengan nilai 0 34 dan 0 19. Hasil analisis keragaman genetik menggunakan gen Cytochrome-C Oxydase Subunit I (COI) pada ikan berkelimpahan rendah diperoleh perbedaan keragaman genetik pada sekuen Mystacoleucus marginatus di standing water yang ditandai dengan adanya substitusi pada tiga basa nukleotida yaitu pada basa ke 363 381 dan 601 sedangkan sampel Macrognathus aculeatus memiliki kesamaan dengan sampel Macrognathus aculeatus pada GenBank.