Skripsi

Prediksi in silico potensi senyawa kaempferia galanga terhadap protein caga pada helicobacter pylori sebagai kandidat obat anti-gastric cancer / Annasa Sabatia

Abstrak
Helicobacter pylori dapat ditemukan pada epitel lambung dan dapat menginfeksi 60 3% populasi di dunia. Salah satu faktor virulensi yang berperan penting dalam proliferasi sel dan apoptosis pada sel epitel lambung adalah Cytotoxin-associated-gene (CagA). Upaya yang dilakukan untuk mengatasi kanker lambung akibat infeksi dari H. pylori yaitu dengan pemberian kombinasi Proton Pump Inhibitor (PPI) dan antibiotik yang dapat menyebabkan resistensi bakteri terhadap antibiotik. Tujuan penelitian ini adalah untuk memprediksi potensi senyawa Kaempferia galanga dalam menghambat CagA secara in silico. Senyawa didapat dari web database PubChem sedangkan struktur kristal CagA didapatkan dari Protein Data Bank. Uji parameter Lipinski menggunakan Lipinski rsquo s Rule of Five. Proses docking protein dengan ligan melalui AutoDock Vina dalam PyRx sedangkan interaksi molekular melalui PyMol dan Ligplot . Uji toksisitas dilakukan dengan webserver ADMET. Hasil studi menunjukkan bahwa sepuluh senyawa potensial yang digunakan dalam penelitian ini menunjukkan berbagai nilai afinitas ikatan hydrogen dan interaksi hidrofobik pada tiap senyawa dan kontrol obat. Senyawa yang diduga paling potensial untuk dikembangkan menjadi antikanker CagA adalah luteolin dan cyclo-(L-Pro-L-Tyr). Senyawa tersebut memiliki afinitas yang paling baik dan interaksi konsisten dengan protein target. K. galanga potensial sebagai antikanker melalui inhibisi H. pylori.

Informasi Detail

DDC

Rs 579.323 SAB p

Prodi

Universitas Negeri Malang. Program Studi Biologi, 2021.

Deskripsi Fisik

ix, 19 lembar. : ilus. ; 30 cm

Bahasa

Indonesia

No Reg

05941/KI/22

Edisi

Skripsi (Sarjana)--Universitas Negeri Malang. 2021

Subjek

1. HELICOBACTER PYLORI - OBAT ANTIGASTRIC CANCER
2. HELICOBACTER PYLORI - ANTIGASTRIC CANCER DRUG

Pembimbing

1. Dwi Listyorini; 2. Wira Eka Putra

Lampiran Berkas