Skripsi

Analisis potensi naringenin dari biji anggur (vitis vinifera l.) dalam menghambat angiogenesis pada perkembangan awal kanker payudara melalui wnt5a signaling pathway secara in silico / Maulida Wulandari

Abstrak
Kanker payudara merupakan salah satu jenis kanker yang paling umum dan mematikan ditandai dengan pertumbuhan sel ganas pada jaringan payudara. Menurut data dari Global Cancer Observatory terdapat 66.271 kasus baru kanker payudara di Indonesia pada tahun 2022 atau sekitar 16 2% dari total 408.661 kasus kanker baru. Hingga saat ini kanker payudara masih menjadi tantangan medis yang belum sepenuhnya teratasi. Pengobatan yang tersedia umumnya berfokus pada penghambatan proliferasi sel kanker tanpa mempertimbangkan mekanisme spesifik yang mendasari aktivitas sel kanker tersebut. Saat ini pendekatan terapi yang lebih spesifik sedang dikembangkan salah satunya melalui penghambatan angiogenesis yaitu proses pembentukan pembuluh darah baru yang mendukung pertumbuhan dan penyebaran tumor. Protein-protein yang berperan dalam angiogenesis diketahui terdeteksi melalui jalur pensinyalan Wnt5a yang berkontribusi dalam mendorong migrasi sel endotel serta remodeling vaskular. Oleh karena itu penelitian ini bertujuan untuk mengeksplorasi potensi senyawa naringenin dari biji anggur (Vitis vinifera L.) dalam menghambat angiogenesis melalui interaksinya dengan beberapa protein target yaitu FZD1 FZD2 ROR1 ROR2 Tie1 Tie2 VEGF1 dan VEGF2. Penelitian dilakukan secara analisis deskriptif eksploratif dan terdiri dari empat tahapan yaitu (1) Preparasi protein dan ligan (2) Molecular docking (3) Visualisasi docking (4) Molecular dynamics. Hasil penelitian menunjukkan hasil dari molecular docking dengan nilai binding affinity terbaik pada ligan uji naringenin yaitu protein FZD1 (-9.15) ROR1 (-6.6) Tie 2(-11.14) dan VEGF2 (-8.22). Pada hasil visualisasi 2D molecular docking ditemukan residu asam amino GLU885 tetapi pada jenis ikatan yang berbeda. Hasil analisis molecular dynamics terhadap kompleks protein ndash ligan pada naringenin menunjukkan nilai RMSD dan RMSF yang stabil rendah pada protein VEGF2 yang menandakan stabilitas dan fleksibilitas kompleks selama simulasi.

Informasi Detail

DDC

SKRIPSI DIGITAL

Prodi

Universitas Negeri Malang. Program Studi Bioteknologi, 2025.

Deskripsi Fisik

xiv, 73 hlm. : ilus.

Bahasa

Indonesia

No Reg

4914/RS/25

Edisi

Skripsi (Sarjana)--Universitas Negeri Malang. 2025

Subjek

1. NARINGENIN — AKTIVITAS ANTIKANKER
2. NARINGENIN — ANTI-CANCER ACTIVITY

Pembimbing

1. Dwi Listyorini, M.si, D.sc; Dr. Muh. Ade Artasasta, S.si

Lampiran Berkas