Skripsi

Identifikasi spesis katak di Universitas Negeri Malang berdasarkan karakter morfologi dan DNA barcoding / Dian Ratri Wulandari

Abstrak
Kata Kunci identifikasi katak DNA Barcoding cytochrome-c oxidase subunit-I (COI) Universitas Negeri Malang (UM) yang terletak di Kota Malang telah mengalami perkembangan yang pesat. Pembangunan berbagai fasilitas penunjang sedang dilakukan untuk mendukung hal tersebut. Pembangunan tersebut menyebabkan berkurangnya area asri yang merupakan habitat dari katak. Katak memiliki peran di alam salah satunya adalah sebagai indikator lingkungan. Keberadaan katak menunjukkan bahwa tempat tersebut belum tercemar karena katak memiliki kulit yang permeabel dan siklus hidup yang kompleks. Jika lingkungan tercemar maka kehidupan katak akan terganggu bahkan bisa membunuh katak yang ada di lingkungan tersebut. Penelitian ini dilaksanakan untuk mengungkap spesies katak yang hidup di UM berdasarkan karakter morfologi dan morfometrik. Selain itu untuk mengungkap hubungan kekerabatan antar spesies katak yang hidup di lingkungan UM berdasarkan DNA Barcoding gen Cytochrome-c oxidase subunit I (COI). Penelitian ini merupakan penelitian deskriptif eksploratif. Pengamatan morfologi dilakukan berdasarkan karakter morfologi dan morfometrik sedangkan hubungan kekerabatan genetik dianalisis dengan menggunakan DNA Barcoding gen COI. Berdasarkan karakter morfologi dan morfometrik ditemukan lima jenis (bentuk) dan dikelompokkan menjadi empat spesies yaitu Duttaphrynus melanostictus (jenis 1) Hylarana chalconota (jenis 2 dan 3) Polypedates leucomystax (jenis 4) dan Kaloula baleta (jenis 5). Dari empat spesies tersebut tiga spesies sama dengan spesies yang ditemukan pada tahun 1995 yaitu Duttaphrynus melanostictus Polypedates leucomystax Kaloula baleta dan satu spesies baru yaitu Hylarana chalconota. Isolasi sekuens barcode gen COI hanya berhasil dilakukan pada spesies Hylarana chalconota yang memiliki dua bentuk yang disebut dengan jenis 2 dan jenis 3. Jenis 2 memiliki corak hitam di kulitnya (bernoktah) dan jenis 3 tidak memiliki corak hitam di kulitnya (tidak bernoktah). Analisis genetik yang dilakukan pada jenis 2 dan jenis 3 dilakukan dengan menggunakan beberapa software yaitu DNA Baser BioEdit BLAST Clustal X dan MEGA 5. Konstruksi topologi pohon filogenetik dilakukan dengan menggunakan metode Maximum Likelihood Neighbor Joining Minimum Evolution dan Maximum Parsimony. Dari keempat motode tersebut hasil terbaik ditunjukkan oleh metode Maximum Likelihood yang menunjukkan jenis 2 dan jenis 3 berkerabat dekat dengan Rana rugosa dan berada dalam kelompok famili Ranidae. Selain itu jenis 2 dan jenis 3 berada dalam satu clade dengan jarak evolusi yang berbeda.

Informasi Detail

DDC

Rs 597.8904 WUL i

Prodi

Universitas Negeri Malang. Program Studi Biologi, 2012.

Deskripsi Fisik

vii, 66 lembar : il., tab. ; 30 cm

Bahasa

Indonesia

No Reg

00822/KI/13

Edisi

Skripsi (Sarjana)-- Universitas Negeri Malang, 2012

Subjek

1. KATAK - MORFOLOGI

Pembimbing

1. Dwi Listyorini ; 2. Ibrohim

Lampiran Berkas