Skripsi

Isolasi mRNA exon-2 Gen Pun1 pada Capsicum frutescens L. kultivar cakra hijau / Shelly Zairina

Abstrak
ABSTRAK Zairina Shelly. 2015. Isolasi mRNA exon-2 Gen Pun1 Pada Capsicum frutescens L. kultivar Cakra Hijau. Skripsi Jurusan Biologi Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Universitas Negeri Malang. Pembimbing (I) Dra. Dwi Listyorini M.Si. D.Sc (II) Dra. Eko Sri Sulasmi M.S. Kata kunci Pun1 exon-2 mRNA Capsicum frutescens L. kultivar Cakra Hijau Pun1 exon-2 cDNA Sekuen utuh DNA gen Pun1 dari Capsicum frutescens L. kultivar Cakra Hijau hasil penelitian-penelitian sebelumnya menunjukkan bahwa gen Pun1 terdiri dari dua exon yang dipisahkan oleh satu intron. Pada exon-2 terdapat kodon stop yang menentukan berakhirnya proses sintesis protein yang dikode oleh gen tersebut. Penelitian ini bertujuan untuk mendapatkan dan mengetahui sekuen exon-2 mRNA gen Pun1 dari C. frutescens kultivar Cakra Hijau serta mengetahui similiratasnya dengan sekuen exon-2 gen Pun1 pembanding. Isolasi mRNA gen Pun1 dilakukan dengan mengikuti protokol isolasi RNA Tri Reagent 61666 dan kemudian diamplifikasi dengan teknik Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction (RT-PCR) menggunakan primer forward 5 -GAA GGT GGC AGA AGA ATC AG-3 dan reverse 5 -TTA GGC AAT GAA CTC AAG GA-3 . Amplifikasi dengan teknik RT-PCR menghasilkan fragmen exon-2 sepanjang 591 bp dengan 10 basa lebih pada ujung 5 upstream dan 2 basa lebih pada ujung 3 downstream dari kodon stop. Sekuen cDNA exon-2 memiliki tingkat similaritas sebesar 97% terhadap DNA exon-2 gen Pun1 C. frutescens kultivar Shuanla tingkat similaritas sebesar 98% terhadap DNA exon-2 gen Pun1 C. frutescens kultivar BG2814-6 dan tingkat similaritas sebesar 91% terhadap DNA exon-2 gen Pun1 C. frutescens kultivar Cakra Hijau.

Informasi Detail

DDC

Rs 583.79 ZAI i

Prodi

Universitas Negeri Malang. Program Studi Biologi, 2015.

Deskripsi Fisik

viii, 50 lembar : il., tab. ; 30 cm

Bahasa

Indonesia

No Reg

03272/KI/15

Edisi

Skripsi (Sarjana). Universitas Negeri Malang, 2015

Subjek

1. CABAI - GEN, ISOLASI
2. CAPSICUM
3. CHILI

Pembimbing

1. Dwi Listyorini ; 2. Eko Sri Sulasmi

Lampiran Berkas