Skripsi
Studi hubungan kuantitatif struktur aktivitas turunan etil 2-amino-4-fenil-6-okso-1,4,5,6-tetrahidropirimidin-5-karboksilat sebagai inhibitor neuraminidase / Catra Mandra Cahyana
Abstrak
ABSTRAK Cahyana Catra Mandra. 2017. Studi Hubungan Kuantitatif Struktur Aktivitas (HKSA) Turunan Etil 2-amino-4-fenil-6-okso-1 4 5 6-tetrahidropirimidin-5-karboksilat Sebagai Inhibitor Neuraminidase. Skripsi Jurusan Kimia Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Universitas Negeri Malang. Pembimbing (1) Dr. H. Yahmin S.Pd. M.Si. (II) Dr. Siti Marfu ah M.S. Kata kunci inhibitor neuraminidase IC50 deskriptor ARM HKSA Penemuan senyawa baru dengan aktivitas farmakologis penting karena telah muncul penyakit yang semakin resisten seperti penyakit flu. Penanganan penyakit flu dapat dilakukan menggunakan inhibitor neuraminidase. Senyawa turunan etil 2-amino-4-fenil-6-okso-1 4 5 6-tetrahidropirimidin-5-karboksilat telah dilaporkan memiliki aktivitas IC50 pada neuraminidase yang cukup tinggi sehingga potensial untuk dikembangkan. Prediksi aktivitas inhibisi neuraminidase dari senyawa turunan tersebut dapat dilakukan menggunakan studi hubungan kuantitatif struktur aktivitas (HKSA). Studi HKSA pada penelitian ini menggunakan 6 deskriptor yaitu indeks Balaban Kappa-1 Chi(0) refreaktivitas molekul momen dipol dan energi total. Nilai dari keenam deskriptor tersebut diambil menggunakan Material Studio 7.0 dari struktur yang sebelumnya telah dioptimasi menggunakan metode DFT B3LYP dan basis set 6-31G(d). Tiap struktur senyawa dengan nilai deskriptor yang diperoleh dikelompokkan dan dilakukan analisis regresi multilinier (ARM) untuk memodelkan persamaan HKSA. Persamaan HKSA yang diperoleh dilakukan uji Q2 (LMO-CV) dan R2pred untuk memastikan model persamaan HKSA yang dibuat telah masuk dalam kriteria HKSA. Berdasarkan hasil analisis diperoleh persamaan HKSA terpilih sebagai berikut. pIC50 pred 11 742 10 153 x Indeks Balaban 3 113 x Kappa-1 4 955 x Chi(0) 0 0693 x Refraktivitas Molekul 0 181 x Momen Dipol 0 0018 x Energi Total Berdasarkan 10 senyawa hasil modifikasi yang diprediksi etil 2-asetamino-4-(2-butoksi-4-klorofenil)-6-okso-1 4 5 6-tetrahidro-pirimidin-5-karboksilat merupakan yang paling potensial untuk disintesis dengan aktivitas pIC50 prediksi sebesar 4 93. ABSTRACT Cahyana Catra Mandra. 2017. Quantitatif Structure Activity Relationships (QSAR) Study of Ethyl 2-amino-4-phenyl-6-oxo-1 4 5 6-tetrahydropyrimidine-5-carboxylate Derivatives as Neuraminidase Inhibitor. Thesis Chemistry Department Math and Natural Science Faculty State University of Malang. Supervisor (1) Dr. H. Yahmin S.Pd. M.Si. (II) Dr. Siti Marfu ah M.S. Keyword neuraminidase inhibitors pIC50 descriptor MLR QSAR Discovery of new compounds with pharmacological activity is important because there are some disease show more resistant respond like flu. Threatment of flu can be done with neuraminidase inhibitors. Ethyl 2-amino-4-phenyl-6-oxo-1 4 5 6-tetrahydropyrimidine-5-carboxylate derivates have been reported that it has potential activity as neuraminidase inhibitor. Neuraminidase inhibiton activity prediction of it s derivate compounds can be done by quantitative structure activity relationships (QSAR) study. QSAR study on this research used 6 descriptors there are Balaban indices Kappa-1 Chi(0) Molecular Refractivity Dipole Moment and Total Energy. Those descriptor values taken by Material Studio 7.0 from structure that have been optimized with DFT B3LYP method and 6-31G(d) basis set. Each compounds structure with it s descriptors values clasified and analyzed by multilinear regression (MLR) analysis to make QSAR equations model. QSAR equations then done with Q2 (LMO-CV) dan R2pred test to ensure that QSAR equation model include in QSAR criteria. Depend on analysis results there are choosed QSAR equation write down below. pIC50 pred 11 742 10 153 x Balaban Indices 3 113 Kappa-1 4 955 x Chi(0) 0 0693 x Molecular Refractivity 0 181 x Dipole Moment 0 0018 x Total Energy Depend on 10 modified compounds predicted ethyl 2-acetamino-4-(2-butoxy-4-chlorophenyl)-6-oxo-1 4 5 6-tetrahydro-pyrimidine-5-carboxylate is the most potential compound for synthesize which have pIC50 prediction value 4 93.